研究人員發現，某些癌細胞表達的基因負責血液凝固，這有可能成為癌症治療中抗凝血劑的目標。來自HSE的研究人員發現了對最具侵略性的透明細胞腎癌亞型具有特殊意義的基因。HSE計算機科學系國際生物信息學實驗室的研究員Grigory Puzanov分析了456名該疾病患者的數據，並確定了預後有利或不利的癌症亞型。該研究結果發表在《科學報告》雜誌上。

透明細胞腎癌（CCRC）是腎癌的一種類型，其特點是腫瘤中存在透明細胞。它是成年人中最常見的腎癌類型，約佔所有腎癌的70-80%。CCRC傾向於快速生長和擴散，它往往在後期被診斷，因為它已經擴散到身體的其他部位。

在過去的幾十年裡，CCRC新病例的數量一直在增加。雖然有大量關於這種疾病的數據，但仍然缺乏可以幫助預測其臨床過程的特定人類基因的信息。

Puzanov的研究結果揭示了哪些ccRCC亞型比其他亞型更危險，哪些人類基因似乎應該對該疾病的進展負責。這一新信息對於早期發現侵襲性腫瘤和為ccRCC患者設計個性化治療方案具有重要意義。

作者分析了來自The Cancer Genome Atlas（TCGA）的456個腫瘤樣本的數據，這些樣本沒有進行放療或額外的藥物治療。使用k-means方法將樣本聚類為具有類似特徵的亞組，確定了具有不同生存率的亞型。對於基因聚類，Puzanov選擇了2000個在ccRCC中表達模式高度可變的基因。

基因表達是一個基因被讀取和復制以產生信使RNA（mRNA）的過程，然後用於合成蛋白質。

研究人員便攜的一個生物信息學算法運行了100次，每次都是根據2000個基因的表達模式的相似性對腫瘤樣本進行分類。三個具有不同生存率的集群（亞型）被識別出來。存活率最低的集群與轉移和對後續治療反應最差有關。

該研究分幾個階段進行。在第一階段，為了更好地了解可能影響疾病進程的遺傳因素，對每個集群的特徵進行了研究。然後，研究作者確定了高生存率和低生存率集群所特有的關鍵基因，並為其合成由這些基因編碼的蛋白質構建了一個相互作用的網絡。

Puzanov的分析確定了哪些基因編碼的蛋白質具有最高的網絡連接數。發現存活率最差的集群與MFI2、CP、APOB和ENAM基因有關，這些基因已知參與胰島素樣生長因子（一種與胰島素結構相似的蛋白質）的運輸和蛋白質的翻譯後修飾。此外，低存活率亞型特有的是編碼與血液凝固有關的纖維蛋白原和凝血酶原的基因（FGA、FGG和F2）。

“這些關鍵基因中的一些可能會影響抗腫瘤療法的療效。例如，CP、FGA和FGG基因的活性增加與尼沃魯單抗的不良反應有關，而APOB和ENAM的高表達則預測對舒尼替尼缺乏反應。這些知識可以幫助為惡性腫瘤患者開出最合適的靶向治療處方”，HSE大學計算機科學系生物信息學國際實驗室研究員Grigory Puzanov這樣表示。

據該研究人員稱，聯合使用常規抗腫瘤藥物和抗凝劑（有助於防止血栓的藥物）可以提高癌症治療的效果。因此，有證據表明，常用於治療癌症患者血栓栓塞事件的肝素有助於患者的生存，並具有抗轉移的活性。