新研究可能將復雜生命的進化與基因的”暗物質”microRNA聯繫起來
新的研究表明,microRNA在大腦的高級發展中起著關鍵作用,包括在人類中。章魚以其非凡的智慧吸引了科學家和公眾,從使用工具到參與創造性遊戲、解決問題,甚至從水族館逃出。現在,它們的認知能力可能為理解複雜生命和認知的進化提供重要的啟示,包括人類的大腦。
來自達特茅斯學院和德國馬克斯·德爾布呂克中心(MDC)的一個國際研究小組在《科學進展》雜誌上發表了一項研究,揭示了章魚是第一個含有大量基因調控microRNA的已知無脊椎動物。兩種章魚的基因被發現隨著進化時間的推移,microRNA的數量增加,而microRNA與具有特定功能的高級細胞的發展有關,這一發現以前只在人類、哺乳動物和其他脊椎動物身上觀察到。
共同通訊作者、達特茅斯大學生物科學教授凱文·彼得森說,當與章魚的已知智能相結合時,這些發現為microRNA是智能生命進化的關鍵這一理論提供了重要支持。章魚和魷魚–它們都屬於一種被稱為頭足類的軟體動物–的神經系統獨立於脊椎動物而進化。然而,在章魚和脊椎動物中普遍存在的microRNA表明,這些分子在高級認知中具有共同的作用。
彼得森說:”microRNA被稱為動物基因組的’暗物質’–它們不製造蛋白質,但它們調節蛋白質的表達,”他指的是被認為構成宇宙大部分的假設物質形式,他說:”這是所有無脊椎動物中唯一一個microRNA急劇增加的例子,這些基因都在大腦中表達。這一直是對假說的一個重大考驗,即它不是脊椎動物所特有的。這是一個重要的時刻–我們發現了複雜生命的秘密,而復雜生命的秘密就是microRNA。”
microRNA在1993年由維克多-安布羅斯首次報導,他在1992-2007年期間是達特茅斯大學的教授,現在是馬薩諸塞大學醫學院的教授。近15年來,彼得森和他的研究小組對各種動物物種的基因進行了測序,以便將microRNA與復雜的組織發展和大腦進化聯繫起來。
在最新的論文中,Peterson的研究小組與共同通訊作者、麻省理工學院系統生物學教授Nikolaus Rajewsky的實驗室合作,該實驗室擁有大量關於章魚物種的RNA數據,特別是普通章魚(Octopus vulgaris)。彼得森和共同作者、達特茅斯大學2022級的彼得-查博特通過從章魚物種中測序的microRNA的原始數據,確定了在這些動物中新的或已經發現的特定序列。Chabot說,他們的工作提供了一個有組織和有註釋的數據集,這對論文的發現至關重要。
彼得森的研究表明,像胎盤哺乳動物這樣的生物,其基因的數量和復雜性隨著進化時間的推移而增加,也表現出越來越多的microRNA的濃度。另一方面,像寄生蟲這樣的生物隨著它們變得不那麼複雜,已經失去了祖先的基因–以及microRNA。
“為了擁有新的認知能力和行為需要新的細胞類型,”彼得森說。”在胎盤哺乳動物和頭足類動物–也是我們看到這些microRNA表達的基因的地方。在過去5億年中似乎沒有什麼變化的動物沒有非常多的microRNA。每次我們測試這個假說時,我們都發現它非常可行,而且我們還無法反駁它。這就是這篇論文特別令人興奮的地方,”他說。
章魚擁有一種不尋常的智慧。2016年,一隻名叫Inky的章魚從新西蘭國家水族館逃出,它從魚缸的縫隙中滑過,用腕足把自己帶到幾英尺高的地板上,然後再進入一條近150英尺長的排水管,通向大海–以及他的自由,成為國際頭條。人們還觀察到章魚用廢棄的椰子殼收集和建造庇護所,並利用水流與各種物體玩捉迷藏。
研究報告的共同作者、挪威特羅姆瑟大學的研究小組組長巴斯蒂安-弗洛姆說,這種智慧可能源於microRNA在細胞功能多樣化方面的作用,他與彼得森實驗室合作進行研究,並建立了在線microRNA數據庫MirGeneDB。
弗洛姆說,複雜生物體內的細胞執行專門的任務,這意味著周圍的細胞需要被校準以執行額外的功能。”microRNA就像燈的開關或調光器,可以打開並調節一個細胞中成千上萬種蛋白質的表達,並指定細胞可以做什麼。這是個數字遊戲。牡蠣和蛞蝓有microRNA,但是在頭足類動物–尤其是章魚中,它們的數量激增,與它們的智力相關。”