世界上最大的自閉症研究發現134個新基因與此病有關
病童醫院(SickKids)的研究人員在迄今為止最全面的自閉症全基因組測序分析中揭示了與自閉症譜系障礙(ASD)有關的新基因和遺傳變化,提高了我們對ASD的基因組基礎的認識。這項發表在《細胞》上的研究利用全基因組測序技術分析了超過7000名自閉症患者和另外13000名兄弟姐妹和家庭成員的整個基因組。
研究發現了134個與自閉症有關的基因,並確定了一系列可能與自閉症有關的遺傳變化,特別是基因拷貝數變異,包括大約14%的自閉症參與者中存在的與自閉症有關的罕見變異。
大部分數據來自自閉症之聲MSSNG數據庫,這是世界上最大的自閉症全基因組數據集,它為自閉症研究人員提供了免費、開放的數千個測序基因組。
多倫多大學遺傳學和基因組生物學高級科學家、SickKids研究主任兼麥克勞克林中心主任斯蒂芬-舍爾博士說:”通過對所有參與者的全基因組進行測序,並在MSSNG參與家庭的深度參與下形成我們的研究重點,我們最大限度地挖掘潛力,並允許分析包括所有類型的變體,從最小的DNA變化到影響整個染色體的變體。”
該論文的主要作者、SickKids遺傳學和基因組生物學項目副研究員Brett Trost博士指出,WGS的使用使研究人員能夠發現原本無法檢測的變體類型。這些變體類型包括複雜的DNA重排,以及串聯重複擴展,這一發現得到了SickKids最近關於自閉症和重複多次的DNA片段之間聯繫的研究支持。該研究還考察了母系遺傳的線粒體DNA的作用,並發現其占自閉症的2%。
該論文還指出,與有多個自閉症患者的家庭相比,只有一個人患有自閉症的家庭在自閉症遺傳學方面存在重要的細微差別。令研究小組驚訝的是,”多基因分數”–通過匯總整個基因組中數千個常見變異體的影響來估計一個人患自閉症的可能性在多重自閉症發病家庭中準確率並不高。
“這表明,多胞胎家庭中的自閉症可能更有可能與從父母那裡繼承的罕見的、高度影響的變體有關。”特羅斯特說:”由於與自閉症相關的遺傳學和臨床特徵都非常複雜多樣,像我們使用的這種大型數據集對於讓研究人員更清楚地了解自閉症的遺傳結構至關重要。”
研究小組說,研究數據可以幫助擴大對可能與自閉症有關的變體範圍的調查,以及更好地了解85%的自閉症患者的遺傳原因,這些問題仍未解決。在《自然-通訊》上發表的對紐芬蘭省325個自閉症家庭的關聯研究中,Scherer博士的團隊發現,自發的、罕見遺傳的和多基因的遺傳因素組合在同一個人身上可能會導致不同類型的自閉症。
蘇珊娜-劉易斯博士是不列顛哥倫比亞省兒童醫院研究所的遺傳學家和調查員,他對參加研究的許多家庭進行了診斷,她說:”總的來說,這些最新發現代表著在更好地理解與ASD相關的複雜遺傳和生物迴路方面邁出了一大步。這個豐富的數據集還提供了一個機會,可以深入研究可能決定個人發展這種複雜狀況的機會的其他因素,以幫助未來治療方法的個體化。”