《刺客教條：影》黑武士彌助在日本引起很大爭議，有人發請願書呼籲中止該作發售，有超過10萬人響應。對此育碧已於7月23日對此事進行了致歉，並做出解釋。

關於《刺客教條：影》的爭議，也牽涉到歷史問題。日本大學法學部副教授托馬斯‧洛克利(Thomas Lockley)曾在自己書中提到：「在日本戰國時期，當地名士為了彰顯權力，興起了使用非洲奴隸的潮流」。對於這個說法，有歷史學家抨擊其是誹謗，並擔心「虛假歷史」傳播。

對於托馬斯·洛克利的著書，日本黨派「從NHK手中保護國民的黨(NHKから國民を守る黨)」的眾議院議員浜田聡認為，如果把想像寫出來的東西當成史實、並在全世界流傳開來的話，偽造的歷史就會變成真正的歷史。

對此浜田聡就此事詢問了一些官方部門的意見，文部科學省回應稱：「一般來說，如果家用遊戲的內容被懷疑違反公序良俗，我們會採取慎重的處理」。外務省回應稱：“由於這是遊戲中的故事，與外交無關，因此我們無法回應這一問題”，經濟產業省則回應稱：“恕不對特定遊戲發表相關評論”。