這次嫦娥六號任務計畫前往月球背面南極-艾特肯盆地，進行形貌探測和地質背景勘察等工作，去發現並採集不同地域、不同年齡的月球樣本。從火箭發射到嫦娥六號取到月背樣本返回地面，整個過程要經歷50多天。專家介紹，這50多天，嫦娥六號任務設計周密，環環相扣、步步關鍵。

根據嫦娥六號任務工程整體發射場工程技術組長胡震宇介紹，嫦娥六號任務主要經歷11個飛行階段，分別是發射入軌段、地月轉移段、近月制動段、環月飛行段、著陸下降段、月面工作段、月面上升段、交會對接與樣品轉移段、環月等待段、月地轉移段、再入返回階段。其間，也涉及探測器的四個組成部分，也就是上升器、著陸器、返回器、軌道器的多次分離和轉移。嫦娥六號可以說是環環相扣、步步關鍵。

從5月3日嫦娥六號任務發射後，經過2000多秒的飛行，火箭會將嫦娥六號送入預定軌道，完成星箭分離，嫦娥六號開始奔向月球。整個奔月路大概有5天，在快到達月球的時候，嫦娥六號要踩一腳煞車，從而被月球捕獲，進入環月軌道。

在環月階段，嫦娥六號將以20天左右的時間調整好位置，為落月做準備。

當萬事俱備，嫦娥六號就會開始落月，並在月面工作48小時完成月背樣品採樣。採樣完成後將進行月面上升、環月軌道交會對接等工作。這段期間，嫦娥六號也將在環月軌道上進行多項科學探測。

胡震宇介紹，嫦娥六號搭載了4個國際載荷，法國氡氣探測器對月球表面氡氣同位素進行原位探測；歐空局月表負離子分析儀對月球表面負離子進行探測，研究等離子體和月面的相互作用機制；巴基斯坦立方星進行在軌成像任務；義大利雷射角反射器作為在月球背面的定位絕對控制點，可以與其他月球偵測任務進行聯合測距與定位研究。

在完成全部工作任務後，嫦娥六號就將開啟回家之路。經過約5天飛行再入大氣層，返回四子王旗著陸場，整個月背出差之旅要進行50多天。