巴斯德研究所法國國家大腸桿菌、志賀氏菌和沙門氏菌參考中心的科學家檢測到了廣泛耐藥（XDR）的志賀氏菌株的出現。志賀氏菌病是一種由志賀氏菌引起的高度傳染性腹瀉病，不僅在發展中國家流行，而且在法國這樣的工業化國家也很流行，研究人員在那裡已經監測了幾年的傳播。

對細菌基因組測序和病例特徵的分析（大多數病例是在男性成年人中報告的）表明，這些最初來自南亞的菌株主要是在男男性行為者（MSM）中傳播。

臨床醫生和實驗室在檢測MSM的性傳播感染（STI）時需要考慮這一觀察結果，如果分離出志賀氏菌株，應進行系統的抗生素分析，以改善對感染XDR菌株的病人的治療。該結果發表在《自然-通訊》雜誌上。

志賀氏菌病是一種高度傳染性的腹瀉疾病，通過糞便-口傳播。在不同類型的志賀氏菌中，Shigella Sonnei（桑內志賀氏菌）是主要在工業化國家流通的物種。桑內志賀氏菌感染可引起短期腹瀉（3-4天），可自行緩解。然而，對於中度至重度病例（血性腹瀉、並發症風險）或在流行病情況下防止人與人之間的傳播，抗生素治療是必要的。因此，志賀氏菌獲得的抗生素耐藥機制限制了治療方案。

在這項研究中，巴斯德研究所國家大腸桿菌、志賀氏菌和沙門氏菌參考中心（CNR-ESS）的科學家們證明了過去17年裡在法國收集的桑內氏菌分離物中抗生素耐藥性的增加。這項研究是基於對7000多個S. Sonnei分離物的分析，以及CNR-ESS在2005年至2021年間進行的全國志賀氏菌病監測中收集的流行病學信息。

CNR-ESS分析了其在法國各地的私營和公共合作實驗室網絡發送的所有細菌分離物。在這期間，被描述為”廣泛耐藥性”（XDR）的分離物在2015年首次被確認。科學家們隨後觀察到，對幾乎所有推薦用於治療志賀氏菌病的抗生素具有抗藥性的XDR分離物的比例顯著增加，並在2021年達到了一個高峰，當時所有索尼氏菌分離物（99例）中有22.3%是XDR。

基因組測序顯示，所有這些法國的XDR菌株都屬於同一個進化譜系，在2007年左右在南亞對一種關鍵的抗生素（環丙沙星）產生了抗性。在包括法國在內的世界幾個地理區域，這些菌株隨後獲得了對其他一線抗生素（特別是第三代頭孢菌素和阿奇黴素）的不同質粒編碼的抗性。

對於嚴重的病例，唯一仍然有效的抗生素是碳青黴烯類藥物或大腸桿菌素，它們必須靜脈注射，導致更積極的治療，需要在醫院環境中進行更複雜的監測。

在法國，在各種情況下都觀察到了XDR分離物：從南亞或東南亞返回的旅行者、2017年在一所學校爆發時（超過90例，導致學校關閉；索引病例從東南亞返回）以及男男性行為者（MSM）。後者被一種流行性克隆體感染，這種克隆體自2020年以來一直在整個歐洲蔓延，但在北美和澳大利亞也被發現。在MSM中循環的這個XDR菌株亞群是最廣泛的，在2021年佔法國XDR菌株的97%。

在南亞和東南亞，頻繁使用抗生素，加上一些可能暴露於這種風險的人重複治療性傳播疾病，增加了選擇XDR志賀菌株的可能性。需要進一步研究以了解不同的臨床感染形式，特別是是否存在可能導致細菌更廣泛傳播的無症狀形式。治療試驗對於確定治療這些XDR志賀氏菌株的有效口服抗生素也至關重要。