微軟表示Windows 10X系統將通過容器方式，不僅可以支持大多數傳統桌面應用程序，而且能確保操作系統免受惡意軟件和性能下降的影響。不過微軟也表示通過容器運行Win32應用會受到限制，部分權限無法獲得支持。

這就意味著要么所有應用都能夠訪問諸如相機這樣的隱私敏感硬件，要么所有都無法訪問。用戶無法在文件管理器中使用由第三方開發者設計的擴展或者插件。例如，能夠移動和復製文件的實用應用TeraCop可能就無法在Windows 10X上使用。

同樣，位於系統托盤中的應用程序（例如電池百分比應用程序，音量控制器或溫度檢測器）可能無法在10X上運行。微軟表示當前沒有計劃支持系統任務欄插件、文件管理器加載項等等。此外微軟還將會阻止鉤子（hook）方式來截取鍵盤和鼠標的操作。

值得注意的是該操作系統是處於只讀狀態，並且是在鎖定模式下設計的。操作系統可以運行從Microsoft Store外部下載的應用程序，但是這些應用程序必須具有良好的信譽和簽名代碼。而且您將無法使用註冊表編輯器來優化Windows。