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科學家呼籲:第一時間共享新型冠狀病毒基因組序列

科學家呼籲:第一時間共享新型冠狀病毒基因組序列

2020-01-27 Comments 0 Comment

記者今天從中國科學院北京基因組研究所國家基因組科學數據中心獲悉,1月26日,國家生物信息中心/國家基因組科學數據中心收錄由中國醫學科學院病原生物學研究所提供的5株2019新型冠狀病毒全基因組序列。這是自2019年12月該病爆發以來,國內公共數據平台首次公開發布數據。

據國家基因組科學數據中心主任鮑一明介紹,從2020年1月以來,陸續有30餘株2019新型冠狀病毒的基因組序列被國內外科學家破譯,絕大部分數據都遞交到由德國建立的全球流感序列數據庫(GISAID)系統。

從該數據庫系統獲取數據需要註冊賬號並經過審核,獲得權限的研究人員才可登錄系統瀏覽數據,並且只能單個下載基因組序列。這就造成了中國產生的數據需要先出口再入口的使用模式和現象,而且數據下載十分繁瑣費時。

2020年1月22日,我國搭建的新型冠狀病毒信息庫(https://bigd.big.ac.cn/ncov)正式上線。

國家生物信息中心/國家基因組科學數據中心一直致力於構建國家級組學數據存儲與共享公共平台,力爭第一時間為國內乃至全球科學家提供基因組數據的存管用服務。此次疫情爆發後,新型冠狀病毒信息庫上線,保持該病毒基因組數據發布動態,持續為國內外科研人員提供方便快捷的數據檢索及下載資源。

此次發布的5株2019新型冠狀病毒基因組序列的序列號為

GWHABKF00000000、

GWHABKG00000000、

GWHABKH00000000、

GWHABKI00000000、

GWHABKJ00000000,

相關項目編號為PRJCA002165。

以上序列可在國家生物信息中心/國家基因組科學數據中心的項目庫或者冠狀病毒序列庫檢索並下載,無需註冊或向數據遞交者申請。

鮑一明告訴中青報·中青網記者,“我們呼籲全國的科研衛生機構在第一時間把2019新型冠狀病毒基因組序列遞交到國家生物信息中心/國家基因組科學數據中心存儲共享,為該病毒的科研和防控提供數據支撐。”

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