關閉像開普勒這樣複雜的航天器不僅需要發送“關閉”命令。根據美國國家航空航天局的說法，太空望遠鏡有一系列安全模式，如果它意外關閉或失去與地球的通信，可以將其重新打開，因此每個都必須禁用。更糟糕的是，飛船正在緩慢旋轉，因此當固定無線電天線指向地球時，發送給它的命令的時間必須要精確。

這些命令中最重要的是關閉Kepler的無線電發射器。雖然它距離地球大約9400萬英里（1.51億公里），處於一個安全的軌道上，但它仍然容易對航行造成危害- 不是因為它可能與另一個航天器發生碰撞，而是因為它的無線電波束可能意外地使另一個探測器失去聯絡。

為了確保開普勒已經關閉，美國宇航局表示它將繼續監視航天器，以確保它已遵守命令。

開普勒望遠鏡於太平洋標準時間2009年3月6日下午7:49在佛羅里達州卡納維拉爾角空軍基地的17B空間發射綜合體上發射，當時負責運載它的是聯盟Delta II火箭，開普勒任務最初定為僅持續3-5年但延長了一倍還多。在其職業生涯中，它找到了2723顆繞其他恆星運行的行星，並已探測到數千名其他潛在候選。

關閉開普勒的決定於10月30日宣布，原因是確定該飛船不再有足夠的推進劑來操作其態度推進器。巧合的是，關閉命令是在其同名的德國天文學家約翰內斯·開普勒去世388週年之際發出的。