2008 年， 科學家在西伯利亞南部的丹尼索瓦洞穴中發現了一塊約4 萬年前的指骨碎片。 2010 年，Svante Pääbo教授（2022 年諾貝爾生理學或醫學獎得主）團隊在Nature發表論文，從這塊骨頭中提取了完整的線粒體DNA 基因組，從而揭示了一種此前未知的古人類——丹尼索瓦人。

2019 年，陳發虎院士團隊等在Nature期刊發表論文，證實了在中國青藏高原東北部的甘肅夏河縣白石崖溶洞中發現的下顎骨化石屬於丹尼索瓦人，這是在丹尼索瓦洞穴以外首次發現丹尼索瓦人化石，也是首次透過古蛋白質分析確定丹尼索瓦人化石。

雖然基因組學研究顯示，丹尼索瓦人曾在亞洲廣泛分佈，但迄今只在寒冷、高海拔地區（西伯利亞、青藏高原）發現了丹尼索瓦人化石。

2025 年4 月10 日，國際頂尖學術期刊Science發表了一篇題為：A male Denisovan mandible from Pleistocene Taiwan 的研究論文。

這項研究透過古蛋白質分析，確定了來自台灣地區的一塊古人類下顎骨化石（澎湖一號）屬於一名男性丹尼索瓦人，該研究從化石中獲得了4241 個氨基酸殘基，並鑑定出兩個丹尼索瓦人特有的突變（AMBNM273V、COL1A2R996K）。這項研究擴展了丹尼索瓦人的地理分佈範圍，顯示其曾廣泛分佈於東亞大陸及邊緣地區，從西伯利亞、青藏高原到台灣，展現了其對寒冷、高海拔和濕熱環境的廣泛適應能力。研究也顯示，丹尼索瓦人與尼安德特人一樣，擁有獨特的強健的齒顎特徵。

20 多年前，一個漁民在台灣西海岸25 公里外的澎湖海峽打撈上來一塊下頜骨，上面還有四顆完整的牙齒，這塊化石被命名為“澎湖1 號”，被認為是在台灣地區發現的首個古人類化石，屬於現代人類的近親，但其具體身份一直是個謎。

在這項研究總，研究團隊花了兩年多時間，精心改進了從古代骨骼化石中提取古蛋白質的技術，他們用酸從「澎湖1 號」的臼齒表面分離出蛋白質片段，並用酵素從下顎骨中提取蛋白質。他們發現了其中兩段蛋白質具有獨特的氨基酸序列突變（AMBNM273V、COL1A2R996K），而這與2008 年在西伯利亞丹尼索瓦洞穴中發現的丹尼索瓦人指骨的基因序列相符。因此，研究團隊確定這塊下顎骨來自一名丹尼索瓦人，透過琺瑯質中的AMELY 蛋白，確認為男性。

這是繼西伯利亞丹尼索瓦洞穴、青藏高原甘肅夏河縣白石崖溶洞之後，第三個透過分子證據確認的丹尼索瓦人化石，是繼青藏高原甘肅夏河縣白石崖溶洞之後第二個透過古蛋白質證據確定的丹尼索瓦人化石。也是首次在東亞低緯度溫暖濕潤地區發現的丹尼索瓦人化石。

男性丹尼索瓦人藝術復原圖

這項研究為東亞地區中-晚更新世古人類的多樣性提供了直接的分子證據，支持了丹尼索瓦人、尼安德塔人與現代智人之間存在基因交流的觀點。證實了丹尼索瓦人能夠適應從寒帶到熱帶的廣泛氣候帶，挑戰了先前認為他們只分佈於寒冷、高海拔地區的觀點。此外，丹尼索瓦人的獨特齒頜形態也為理解古人類多樣性和演化提供例如關鍵證據。

論文連結：

1. https://www.nature.com/articles/nature08976

2. https://www.nature.com/articles/s41586-019-1139-x

3. https://www.science.org/doi/10.1126/science.ads3888