新研究發現武漢華南海鮮市場的動物與COVID-19起源有關
最近的一項研究透過對2020 年初採集的樣本進行廣泛的基因分析，揭示了SARS-CoV-2 可能源自中國市場的動物，這與該病毒在中國從動物傳染給人類的證據相吻合。這項研究發表在《細胞》雜誌上，強調了野生動物在大流行起源中的重要性，以及加強生物安全和公共衛生防備的必要性。
一項新的研究發現，貉和果子狸可能是華南市場上SARS-CoV-2的攜帶者，這支持了受感染動物導致COVID-19大流行的理論。研究結果強調了了解大流行病起源和防止未來人畜共患病蔓延的必要性。
最近的一項全球研究編制了一份在市場上發現的野生動物物種清單，據信這些物種是2019 年末導致COVID-19 大流行的SARS-CoV-2病毒的來源。這項研究是基於中國疾病預防控制中心（CDC）提供的新的元轉錄組數據分析。
這些數據來自2020年1月1日開始在華南海鮮批發市場及其周邊地區採集的800多份樣本，以及早期COVID-19患者的病毒基因組報告。這項研究成果於9月19日發表在《細胞》（Cell）雜誌。
共同通訊作者、法國國家科學研究中心（CNRS）的Florence Débarre 說：”這是關於COVID-19 大流行起源的最重要數據集之一。我們非常感謝這些數據的存在和共享。”
斯克里普斯研究所的共同通訊作者克里斯蒂安-安德森（Kristian Andersen）說：”這篇論文為不斷積累的證據又增加了一層，所有證據都指向同一個情況：受感染的動物在2019 年11 月中下旬進入市場，從而引發了大流行。
亞利桑那大學的共同通訊作者邁克爾-沃羅貝（Michael Worobey）說：”我們以全新和嚴謹的方式分析了中國疾病預防控制中心團隊收集的極其重要的數據。這是對這些數據的權威分析，也是對這些數據如何與我們所掌握的大量有關大流行如何開始的證據相吻合的分析。
2020 年初的市場調查
2020 年1 月1 日，動物被運走後，在市場關閉幾小時後，中國疾管中心的調查人員前往市場採集樣本。他們用棉籤擦拭了攤位的地面、牆壁和其他表面；幾天后，他們再次來到市場，重點檢查了出售野生動物的攤位表面，如籠子和用來搬運動物的推車，然後還從排水溝和下水道採集了樣本。
他們對樣本進行了元轉錄組測序，該技術旨在獲取樣本中所有生物體–病毒、細菌、植物、動物和人類–的所有RNA序列（也可獲取DNA）。劉軍領導的中國疾病預防控制中心團隊於2023 年在《自然》雜誌上發表了他們的數據和結果。然而，文章中並沒有明確指出數據中發現的動物物種的確切身份，而這些動物物種可能代表了似是而非的中間宿主。中國疾病預防控制中心在公共和開放資源庫中共享了他們的定序資料。
根據發表在《細胞》（Cell）雜誌上的對這些數據的最新分析，SARS-CoV-2 與市場上出售的野生動物出現在一些相同的攤位上，包括貉（一種類似狐狸的小動物，身上的斑紋與浣熊相似）和果子狸（一種小型食肉哺乳動物，與獴和鬣狗有關）。在某些情況下，SARS-CoV-2 病毒和這些動物的遺傳物質甚至在同一個拭子上被發現。透過對樣本中的粒線體基因組進行基因分型，確定了確切的動物種類。
Débarre 說：”在中國疾病預防控制中心小組到達之前，許多主要動物物種已經被清理，因此我們無法直接證明這些動物受到了感染。我們在環境樣本中看到了這些動物的DNA 和RNA，其中一些還出現在發現了SARS-CoV-2 的畜欄中。
沃羅貝補充說：”我們知道，正是這些動物在2002 年促成了最初的SARS 冠狀病毒侵入人類。這是我們能做的最危險的事情–捕捉充滿病毒的野生動物，然後讓它們與生活在大城市中心的人類接觸，玩火自焚。
進化分析與市場外溢效應
國際研究小組還對大流行中報告的最早病毒基因組（包括這些環境序列）進行了進化分析，並推斷出感染人類並導致COVID-19 大流行的病毒最可能的祖先基因型。結果表明，在市場疫情爆發之前，受感染的人類即使有，也是極少數。這與市場內從動物到人類的外溢效應是一致的。在緊鄰的上游動物貿易中也可能存在影響有限的溢出效應。
Débarre 說：”在這篇論文中，我們表明與市場相關的序列與市場出現的序列是一致的。SARS-CoV-2的主要多樣性從一開始就存在於市場中。”
新研究發現，在濕市場中與病毒樣本共存或接近的動物物種，最有可能是SARS-CoV-2 的中間宿主。貉是對SARS-CoV-2 易感的動物，2003 年曾攜帶SARS-CoV，是市場野生動物攤位樣本中基因含量最高的動物。在一個帶有SARS-CoV-2 RNA 的攤檔中也發現了果子狸的遺傳物質，這種動物也與早期爆發的SARS-CoV 有關。在SARS-CoV-2 陽性的樣本中還發現了其他物種，如竹鼠和馬來亞豪豬，以及許多其他物種。
雖然這些數據無法證明這些動物中是否有一隻或多只可能受到感染，但研究小組的分析提供了一份明確的清單，列出了最有可能攜帶病毒的物種，並提供了基因信息，可用於幫助追蹤它們的來源。
研究人員強調，了解COVID-19 大流行的起源非常重要，尤其是考慮到最近的其他外溢現象，例如禽流感病毒在美國牛群中的傳播。 “關於SARS-CoV-2 的起源，有很多虛假信息和錯誤信息，”Worobey 說。 「弄清楚這個問題之所以如此重要，是因為它不僅影響美國的國家安全和公共衛生，而且影響全世界的國家安全和公共衛生。而事實是，自從四年多前大流行開始以來，雖然人們越來越重視實驗室安全，但並沒有採取太多措施來降低類似人畜共患病再次發生的幾率。
編譯自/ ScitechDaily