根據央視新聞消息，當地時間1月3日，日本國土交通省公佈了東京羽田機場飛機相撞事故發生前，機場空管部門與日航客機及海上保安廳飛機的通話記錄。記錄顯示，空管部門當時已向日航客機發出了降落許可。

另一方面，在當地時間2日17時45分，空管部門對海上保安廳飛機稱，“請在地面上滑行至跑道等待位置”，尚未允許海上保安廳飛機進入跑道。 

這也意味著，海上保安廳的飛機未經允許進入跑道，是導致這起事故的主要原因之一。

但另據日本廣播協會(NHK)報道，受傷的海保運輸機機長先前表示，他明確接獲允許起飛的指令；日本運輸安全委員會於今日，開始對事故展開調查。

先前通報顯示，日本航空空中巴士A350客機在跑道上與另一架飛機相撞後起火，整個機身完全燒毀，但幸運的是，機內367人的機組人員和乘客全部撤離。

而與日本航空客機相撞的海上保安廳飛機載有6人，除機長1人重傷生還外，其餘5人全部不幸罹難。