研究發現小鼠自備先天性基因療法 可避免基因突變
研究人員發現,小鼠擁有一種天然的基因療法–一種可以避開基因突變的非編碼 RNA。他們能夠設計出一個可編程的版本,它能識別特定的基因突變,並可能用於治療人類的遺傳疾病。
在成為成熟的信使核糖核酸(mRNA)之前,前mRNA會在細胞核內被修改。內含子(RNA 的非編碼部分)被移除,外顯子(RNA 的編碼部分)被拼接在一起,形成成熟的 mRNA。然後,成熟的 mRNA 被輸出到細胞質中,細胞的核醣體”機器”在那裡將遺傳訊息解碼成細胞過程所需的蛋白質。
但是,RNA 也可以透過非編碼 RNA 來調節基因活動,因為非編碼 RNA 的基因序列並不會用於生成蛋白質。 4.5SH 就是這樣一種非編碼 RNA,它只存在於小鼠和大鼠等小型囓齒動物體內。 4.5SH 基因形成了一個大型的串聯重複序列集群,即在一個基因中多次重複的DNA 短序列,每個細胞中的分子數超過 10,000 個。
由日本北海道大學研究人員領導的一項新研究發現,4.5SH RNA 的作用是規避小鼠 DNA 在 mRNA 成熟過程中發生的突變。
研究的通訊作者之一中川伸一說:”4.5SH RNA於20世紀70年代被發現,儘管它在許多類型的組織中大量存在,但其功能40多年來一直是個謎。 “
研究人員發現,敲除小鼠的 4.5SH 基因是致命的,會導緻小鼠在胚胎階段死亡,這表明 4.5SH RNA 是小鼠體內重要的非編碼 RNA。
中川說:”眾所周知,小鼠基因組中編碼重要蛋白質的基因有許多致命突變。 “4.5SH RNA具有大量清除這些突變的能力–本質上,它是一種天然的基因療法,可以防止突變”。
RNA定序顯示,4.5SH RNA能保護轉錄組(所有RNA轉錄本的集合,包括編碼和非編碼)免受異常外顯子的影響,否則這些異常外顯子會引入過早的終止密碼子,即終止蛋白質翻譯過程的訊號,或移幀突變,即改變序列讀取方式的插入或缺失。
透過分析4.5SH RNA 的分子結構,研究人員發現它由兩部分組成:一個是能辨識異常外顯子的感測器模組,另一個是能與異常外顯子鹼基配對的效應模組,以防止它們通過一種稱為替代剪接的過程併入mRNA 中。在替代剪接過程中,一個突變的外顯子會在剪接過程中被跳過,從而產生一種具有相似功能的新蛋白質(稱為異構體),而不會失去原有的蛋白質。
中川說:”據我們所知,這是第一個自然產生的RNA能夠以明確的開/關方式調節替代剪接的例子。我們的研究還表明,這種非編碼 RNA 中的很大一部分可能參與控制替代剪接。 “
4.5SH RNA 可作為小鼠的天然基因治療劑,防止 RNA 變異(左)。透過對4.5SH RNA進行工程設計,有可能將其用於治療人類遺傳疾病(右)中川真一/北海道大學
透過了解4.5SH RNA的模組化結構,研究人員設計出了一種可程式剪接調節器(嵌合RNA),以誘導跳過感興趣的目標外顯子。他們設計的嵌合 RNA 可以成為基因工程的有用工具。
中川說:”我們的發現表明,透過修改4.5SH RNA的感測器模組,有可能開發出只識別特定基因突變的新型基因治療藥物,這樣我們就有可能阻止與疾病相關的有毒區域表達。 “
這項研究發表在《分子細胞》(Molecular Cell)期刊。