隨著3DS 數字商店的關閉，新用戶目前已經無法再使用一款可以同步近20 年《寶可夢》遊戲歷史的應用程序。這款名為《寶可夢虛擬銀行》的3DS 應用允許玩家將寶可夢從遊戲機傳輸至“寶可夢Home”雲儲存，並通過它將原版遊戲中的伙伴帶入之後推出的新作。在3DS 的歷史中，這款應用支持了長達19 年的《寶可夢》作品。

《寶可夢虛擬銀行》一直是一款免費應用。不過此前想要將自己的寶可夢上傳至“Home”，需要支付5 美元訂閱費用才能使用配套的應用程序。如果此前沒有該訂閱，這個名為“PokeTransporter”的應用程序永遠無法下載。然而寶可夢公司此前宣布，在數字商店關閉後，這兩款應用都將免費。

目前數字商店關閉了，用戶已經無法下載這些軟件，甚至包括免費軟件，除非他們此前已經將其加入過庫存中。這意味著即便Transporter 目前已經免費了，除非之前用戶曾花費5 美元訂閱過一次，否則現在依然無法下載它。任天堂和寶可夢公司此前都沒有具體說明會是這種情況。

根據此前沒有支付過訂閱費用的GamesRadar 編輯Dustin Bailey 測試，目前使用《寶可夢虛擬銀行》時，依然會提示用戶需要從數字商店下載Transporter，然而點擊跳轉後，會跳出“此軟件當前不可用”的提示窗口。想要通過正版遊戲收集完整寶可夢圖鑑的玩家現在已經無法實現這一夢想。

Transporter此前也出現了一些小故障，不過此前已經擁有的用戶仍然可以備份他們的寶可夢。對於那些沒有訂閱過的用戶來說，當他們的3DS和卡帶最終損壞時，可能將不得不和自己曾經的伙伴永別。