研究人員開發新方法確定非法交易的黑猩猩來源
利用數以千計的黑猩猩糞便樣本,研究人員創建了第一個野外瀕危黑猩猩的基因組多樣性目錄。這個目錄使他們能夠將沒收的黑猩猩與它們的原產地聯繫起來,目的是遏制非法動物貿易。
據《細胞基因組學》雜誌今天(2022年6月1日)報導,科學家們製作了第一個野生瀕危黑猩猩的基因組多樣性目錄。該目錄包括來自其整個範圍的828個黑猩猩樣本,提供了黑猩猩種群結構和隔離、遷移和連接的精細模式的詳細重建。研究人員利用這些信息設計了一種方法,將沒收的黑猩猩與它們在大約100公里範圍內的來源地聯繫起來,目的是支持打擊黑猩猩和相關產品的非法貿易的努力。
研究人員說,如果沒有泛非計劃(PanAf)在48個地點對成千上萬的黑猩猩糞便樣本進行協調採樣,以及多年來為開發有效檢索和富集糞便樣本中宿主DNA比例方法策略所做的努力,這項工作是不可能的。糞便樣本伴隨著許多技術挑戰,因為它們只包含少量的退化黑猩猩DNA,但它們也有研究瀕危物種的優勢,因為它們可以在對動物干擾最小的情況下進行廣泛的收集。這些方法現在可以被用於研究許多其他瀕危靈長類動物和其他物種。
由於黑猩猩的化石記錄和古DNA是有限的,重建其過去的唯一方法是通過對活體的研究。科學家們承認有四個黑猩猩亞種,但對它們之間的關係一直存在疑問。關於這些亞種之間有多大的聯繫,一直是一個長期的問題。為了在新的研究中探索這些問題,研究人員從目前整個黑猩猩分佈區的800多個非侵入式收集的野生黑猩猩糞便樣本中檢索了部分基因組信息。他們把注意力集中在21號染色體上,這是黑猩猩基因組中最小的連續核序列,也是用於推斷黑猩猩種群結構的大量基因組序列數據的來源。
研究人員在21號染色體上發現了比以前的研究多50%左右的、新的遺傳變體。相關數據集已經成為了解黑猩猩之間最近和過去基因流動的關鍵。此外,它還使我們能夠描述種群最近是否被隔離,或者是否有一個歷史事件造成的隔離。通過描述每個社區或種群的基因組特徵,研究人員還創建了一張地圖,將基因組信息與地理位置聯繫在一起,以便研究人員能夠了解每個種群的情況。