新研究揭示重症COVID-19與其他疾病之間的遺傳聯繫
對美國退伍軍人事務部“百萬退伍軍人計劃”的數據進行的一項新分析發現了COVID-19嚴重程度與各種醫療條件之間的遺傳聯繫,這些醫療條件是重症COVID-19的已知風險因素。美國賓夕法尼亞州費城Michael Crescenz退伍軍人醫療中心的Anurag Verma及其同事於2022年4月28日在開放性期刊PLOS Genetics上發表了這些發現。
一些COVID-19患者的病情比其他人更嚴重。以前的研究已經發現特定人類基因的某些變異與一個人經歷更嚴重的COVID-19有關。這些變異中的一些也可能與其他可能已經被充分理解的醫療條件有關;發現這些共同的變異可以增加對COVID-19的理解,並揭示潛在的新的治療路徑。
雖然與重症COVID-19相關的基因與既定的風險因素和不良後果有關,包括深靜脈血栓,但這些基因的一個重要子集與免疫介導的疾病(如銀屑病、紅斑狼瘡和類風濕性關節炎)的風險降低有相反的關係。來源: Anurag Verma, Katherine Liao, and Scott Damrauer (CC-BY 4.0)
為了識別共享變種,Verma及其同事使用了一個前所未有的基因型信息數據集,該數據集與超過65萬名美國退伍軍人的電子健康記錄數據(EHR)相連。他們進行了一種被稱為全表型關聯研究(PheWAS)的分析,以檢查在經歷重症COVID-19的退伍軍人中經常發現的變種與與廣泛選擇的醫療條件有關的變種之間的聯繫。
分析顯示,與COVID-19有關的某些變種也與COVID-19的已知風險因素有關。與靜脈栓塞和血栓形成以及2型糖尿病和缺血性心髒病有關的變異被發現有特別強的聯繫–這是兩個已知的COVID-19風險因素。
該分析還發現非洲和西班牙裔退伍軍人的重症COVID-19和中性粒細胞減少症之間的遺傳聯繫;這些聯繫在歐洲裔退伍軍人中沒有出現。
在呼吸系統疾病中,特發性肺纖維化和慢性肺泡病與嚴重的COVID-19有遺傳聯繫,但其他呼吸道感染和慢性阻塞性肺病(COPD)則沒有。一些與重症COVID-19相關的變體也與自身免疫性疾病(如銀屑病和狼瘡)的風險降低有關。這些發現強調了在開發新的治療方法時需要仔細權衡免疫系統的各個方面。
儘管PheWAS方法有一些局限性,但這些發現可以幫助加深對COVID-19的理解並指導新療法的開發。
Verma總結說:”這項研究表明了大型生物庫的價值和影響,它將遺傳變異與EHR數據聯繫起來,用於應對當前和未來的大流行病的公共衛生。MVP是美國最多樣化的隊列之一。我們有一個獨特的機會來掃描COVID-19大流行之前記錄的數千種情況。我們獲得了對COVID-19風險因素和疾病並發症的遺傳結構的深入了解。”
共同作者Katherine Liao補充說:”讓我們眼前一亮的是,大量免疫介導的疾病與COVID-19的嚴重表現共享遺傳結構。這些關聯的性質使我們了解到SARS-CoV2病毒是如何推到人類免疫系統的壓力點上的,以及它在抗擊感染的同時保持足夠的控制,以便它不會也成為一個自身免疫的過程,攻擊自我。”