根據媒體報導，《GTA三部曲：終極版》其中包含有授權已經過期的音樂，另外還有包含開發者評論的未編譯代碼。 有玩家在分析三部曲合集的數據檔時發現了這些資訊，這也有可能是R星在遊戲發售之後又將其下架的一個原因。

PC玩家在遊戲發售之後，便由於R星啟動器進入「維護」狀態導致無法正常遊戲。 有使用者針對三部曲檔進行數據挖掘，發現所有因為授權過期而被刪除的《GTA聖安地列斯》音樂實際上仍然存在於遊戲檔之中，遊戲只是不對其進行播放而已。

使用者在推特上表示：「終極版選擇的音樂格式是OGG-VORBIS，《GTA聖安地列斯》包含所有被砍掉的音樂，只是在腳本中禁止播放。 ”

還有使用者對《GTA罪惡都市》進行類似查找，同樣發現了遊戲中被禁止播放的比如邁克爾·傑克遜的音樂。

還有數據挖掘人員發現，遊戲代碼中包含未編譯版main.scm檔，其中包含《GTA 3》、《GTA罪惡都市》和《GTA聖安地列斯》所有的遊戲腳本。 挖掘人員表示，未編譯版本堪稱對遊戲幕後人員感興趣的玩家的”聖杯”，因為里麵包含被刪除的缺失內容，還有當年R星北方工作室員工的資訊。