美國國立衛生研究院的科學家們開發出更快、更便宜的COVID-19檢測方法
美國國立衛生研究院(NIH)的科學家們開發了一種新的樣本製備方法來檢測SARS-Cov-2,即引起COVID-19的病毒。 該方法繞過了提取病毒的遺傳RNA物質,簡化了樣品的純化,並有可能減少測試時間和成本。 該方法是美國國家眼科研究所(NEI)、美國國立衛生研究院臨床中心和美國國家牙科和顱面研究所(NIDCR)的研究人員合作的結果。
診斷測試仍然是抗擊COVID-19大流行病的一個重要工具。 檢測SARS-CoV-2的標準測試包括使用一種稱為定量反轉錄PCR(RT-qPCR)的技術將病毒RNA擴增到可檢測的水準。 但首先,必須從樣本中提取RNA。 在COVID-19大流行期間,RNA提取試劑盒的製造商很難跟上需求,影響了全世界的測試能力。 隨著新病毒變種的出現,對更好、更快的測試的需求比以往任何時候都大。
由NEI醫學遺傳學和眼科基因組學組長Robert B. Hufnagel博士和NEI眼科基因組學實驗室研究員Bin Guan博士領導的團隊使用實驗室供應公司Bio-Rad生產的螯合劑Chelex 100樹脂來保存樣本中的SARS-CoV-2 RNA,以便通過RT-qPCR檢測。
“我們使用具有不同病毒濃度的鼻咽和唾液樣本來評估它們是否可以用於直接的RNA檢測,”本周發表在《iScience》上的關於該技術報告的主要作者Guan說。 答案是肯定的,具有明顯的高靈敏度。 另外,這種製備方法使病毒失活,使實驗室人員處理陽性樣本時更加安全。 ”
Hufnagel的團隊通過使用合成和人類樣本測試各種化學品來確定那些能夠以最小的降解保存樣本中的RNA,同時允許通過RT-qPCR直接檢測病毒的化學品。
為了驗證該測試,NIDCR的Blake M. Warner和他的團隊收集了病人樣本(根據研究協定NIH IRB 20-D-0094),並將它們儲存在病毒運輸介質或NIH癥狀測試設施新開發的螯合樹脂-緩衝液中。
病毒運輸介質中的樣本由NIH臨床中心的COVID-19測試團隊進行測試,該團隊由Karen M. Frank醫學博士領導,使用常規的RNA提取和RT-qPCR測試。 螯合樹脂緩衝液中的樣本被加熱,然後通過RT-qPCR測試病毒RNA。 與標準方法相比,新的製備方法大大增加了可用於測試的RNA產量。
Hufnagel說:「我們認為這種新方法有明顯的好處,可以提高靈敏度,節省檢測成本和時間。 該方法在室溫下穩定RNA,以便在臨床上更容易運輸、儲存和處理。 ”