科學家確定全新微生物群體分解腐爛植物而不產生溫室氣體甲烷
一個來自美國和中國的科學家團隊已經確定了一個全新的微生物群體,它們安靜地生活在世界各地的溫泉、地熱系統和熱液沉積物中。這些微生物似乎在全球碳循環中發揮著重要作用,它們幫助分解腐爛的植物而不產生溫室氣體甲烷。
這個被生物學家稱為門的新群體被命名為Brockarchaeota,以托馬斯-布洛克的名字命名,他是研究生活在極端環境(如黃石國家公園的溫泉)中微生物的先驅者。不幸的是,布洛克於4月4日去世。他的研究導致了一種強大的生物技術工具,即PCR,它被用於基因測序和COVID-19測試。
到目前為止,Brockarchaeota還沒有在實驗室中成功地生長,也沒有在顯微鏡下成像。相反,它們是通過從中國的溫泉和加利福尼亞灣的熱液沉積物樣本中收集到的遺傳物質的碎片中艱難地重建它們的基因組而被識別的。貝克和該團隊使用高通量DNA測序和創新的計算方法來拼湊新描述生物體的基因組。科學家們還確定了它們如何消耗營養物質、生產能量和產生廢物的基因。
新論文的第一作者Valerie De Anda說:”當我們查看公共基因數據庫時,我們看到它們在世界各地被收集,但被描述為’未培養的微生物’,”她指的是其他研究人員從南非的溫泉和懷俄明州的黃石公園,以及印度尼西亞和盧旺達的湖泊沉積物中收集的標本。有幾十年前的基因序列,但沒有一個是完整的。因此,我們重建了這個門類的第一個基因組,然後我們意識到,哇,它們在世界各地,而且完全被忽視了。”
Brockarchaeota是一個更大的、研究不足的微生物群體的一部分,被稱為古細菌。到目前為止,科學家們認為,參與分解甲基化化合物,即腐爛的植物、浮游植物和其他有機物。它們正在使用一種我們不知道在古細菌中存在的新型代謝,這非常重要,因為海洋沉積物是地球上最大的有機碳庫。這些古菌在循環利用碳的同時並不產生甲烷。這使它們在自然界具有獨特的生態地位。
一個門類是一個廣泛的相關生物群體。為了了解門的規模和多樣性,考慮到僅脊索動物門就包括魚類、兩棲動物、爬行動物、鳥類、哺乳動物和海鞘。節肢動物門約佔所有動物的80%,包括昆蟲、蛛形綱(如蜘蛛、蝎子和蜱蟲)和甲殼類動物(螃蟹、龍蝦、蝦和其他美味的海洋生物)。
2020年7月,貝克、德安達和其他人在《自然-微生物學》雜誌的一篇評論文章中提出,在古細菌中可能存在幾個新的門類,包括Brockarchaeota。這項最新的研究為Brockarchaeota增加了十多個新物種,描述了它們的新陳代謝,並證明它們確實是一個明顯的新門類。
除了分解有機物,這些新描述的微生物還有其他的代謝途徑,De Anda推測這些途徑有朝一日可能在從生物技術到農業到生物燃料的各種應用中發揮作用。