蘋果應用商店的佣金抽成系統為該公司帶來了豐厚受益，但也惹來諸多麻煩。繼音樂流媒體服務Spotify後，日本媒體和電商集團樂天也要求歐盟調查蘋果應用商店的反壟斷行為。樂天旗下電子書閱讀器子公司Kobo聲稱，其應用程序託管在蘋果的應用商店中，而應用商店中需要支付的應用都必須使用蘋果的支付系統，該系統對每次購買收取高達30%的佣金。

這意味著，如果Kobo想通過其免費應用銷售圖書，每售出1本書就要支付30%的佣金。

與此同時，蘋果還在推廣自家產品Apple Books，與Kobo等類似產品競爭。多位熟悉Kobo投訴的人士透露，Kobo在投訴中表示，為了避免向蘋果繳納佣金，該公司只能強迫顧客去其網站購買電子書，因而損失了許多業務。

樂天的控訴與Spotify去年在歐洲提起的反壟斷訴訟非常相似。Spotify聲稱蘋果利用其應用商店扼殺創新，限制消費者的選擇，轉而支持自己的Apple Music服務。歐盟委員會尚未對Spotify的投訴做出裁決。

與此同時，以藍牙跟踪設備聞名的Tile上月致信歐盟競爭事務專員，指責蘋果的反競爭行為。Tile認為，蘋果iOS 13.5對藍牙設置的更新使第三方跟踪產品處於不利地位，而蘋果自己的FindMy應用程序在默認情況下則不受同樣的限制。

對於這些控訴，蘋果辯稱，應用商店為開發者提供了強大的經濟生態系統支持，賺取的收入也用於維護應用商店的運營以及執行其內容、隱私和安全指導方針的成本。蘋果和Kobo都沒有立即發表評論。

自從美國司法部和聯邦貿易委員會(FTC)開始審查科技巨頭的反壟斷行為後，蘋果應用商店就成為反壟斷指控的目標，美國監管機構正加大審查力度。今年3月，蘋果還因非法限制批發商銷售蘋果產品的方式而被法國反壟斷機構罰款12億美元。