喜茶官方就南京門店飲品檢出微生物污染一事發文道歉，稱初步了解主要原因是門店操作不規範造成的，如冷藏牛奶放在常溫狀態中太久等，並說明正在進行的整改措施。據江蘇新聞，當地市監局檢測抽取16批次果茶（奶茶），涉及4品牌，5家門店。

結果顯示，4批次果茶（奶茶）存微生物感染（菌落總數及大腸菌群數值超標）。涉事奶茶有喜茶中山路分店的多肉葡萄、多肉芝芝甘露、芝芝桃桃，和喜茶珠江路店的純奶茶。