每秒20億億次計算美國啟用TOP500最強超算尋求新冠病毒藥物
COVID-19新冠病毒目前還沒有特效藥,全球都在加緊研發對應的藥物及疫苗。為了加快藥物研發,美國啟用了目前全球最強的超算Summit,每秒浮點性能可達20億億次。Summit超算位於美國橡樹嶺國家實驗室,2017年底落成,從2018年上半年開始一直位列TOP500超算第一,終結了中國天河2號/太湖之光超算保持的10連冠,不出意外的話今年的2次TOP500冠軍還是它。
Summit超算使用了IBM Power 9處理器及NVIDIA的Tesla V100加速卡,每個節點2組22核Power 9處理器及6組Tesla V100加速卡,單節點性能42TFLOPS,峰值浮點性能200PFLOPS(20億億次),Linpack性能也有143PFLOPS。
在超算的應用領域中,分子動力學是最需要強大運算性能的研究了,此前Summit超算也跑過老年癡呆、阿片類藥物成癮之類的運算,這次研究人員用它來模擬新冠病毒與不同化合物的反應。
據報導,這項研究已經針對8000多種有可能跟病毒蛋白結合的物質做了模擬測試,Summit超算篩選出77個可能有用的化合物,並根據測試結果做了排序。
不過超算的測試結果現在還只是參考,真正確定藥物是否有效還需要很複雜的過程。