2020年1月23日，中國科學院武漢病毒研究所石正麗團隊在bioRxiv預印版平台上發表文章，報導了武漢新型冠狀病毒nCoV-2019可能和SARS一樣來源於蝙蝠。2003年，SARS爆發之後，很多急性呼吸綜合徵相關的冠狀病毒在其天然宿主——蝙蝠中被發現。以往研究表明其中一些SARSr-CoV具有感染人的潛力。

在該篇文章中，石正麗團隊報導了這次在武漢最新發現的冠狀病毒——nCoV-2019，該病毒導致了這一次流行病的爆發。在早期開始的時候，從5名病人體內獲得了該病毒的全基因組，其中這5例基因組基本上一致，並於SARS-CoV的序列一致性有79.5%。重要的是，nCoV-2019與一種蝙蝠中的冠狀病毒的序列一致性高達96%。通過對其保守的7個非結構蛋白進行對比，發現nCoV-2019屬於SARSr-CoV，另外，nCoV-2019進入細胞的受體與SARS-CoV一樣，均為ACE2。

石正麗研究團隊針對新發傳染病防控的重大需求，歷經多年持續研究，以我國蝙蝠攜帶的SARS樣冠狀病毒等重要病毒為研究對象，全面、系統地開展了我國蝙蝠攜帶病毒的分子流行病學、新病毒發現與鑑定、跨種傳播機理等方面的研究，並取得了重大突破，獲得多項原創成果。最重要貢獻包括證實蝙蝠是SARS冠狀病毒的自然宿主，

為SARS的動物溯源提供多個重要證據；首次在我國蝙蝠體內檢測到烈性病毒尼帕病毒和埃博拉病毒抗體；發現腺病毒、圓環病毒等遺傳多樣的新型蝙蝠病毒等，其中關於SARS病毒溯源的代表性研究成果發表在Nature、Science等頂級學術期刊上。研究開創了國內系統研究蝙蝠病毒的先河，對動物源新發病毒病原學、新病毒發現等研究方向的發展起到了積極推動作用；研究團隊也成為國際上蝙蝠病毒研究領域最有影響力的實驗室之一。