在《自然·遺傳學》發表的一項新研究中，來自美國農業部農業研究局和博伊斯·湯普森研究所等機構的研究人員繪製了人工栽培和野生西紅柿的基因組圖譜。該團隊標記了近5000個以前未知的基因，將人工栽培西紅柿的基因組與野生西紅柿的基因組進行比較，並獲得了不少有趣的發現。

2012年科學家首次對普通栽培西紅柿進行了基因組測序，該次測序的西紅柿品種為Heinz 1706。這項新工作將這種觀點擴展到所有定期種植的番茄品種及其“近親”的完整基因組。這包括來自725種不同品種西紅柿的所有基因，並且在此過程中，該團隊發現了額外的4873個基因，這些基因未包括在Heinz 1706基因組中。

在將人工栽培的西紅柿與其野生對應物進行比較時，研究人員注意到我們通常在超市中購買的西紅柿丟失了數千種基因。在追求能夠以更快的速度獲得更大更多西紅柿的過程中，種植者似乎放棄了味道等特性。

“構建這種泛基因組最重要的發現之一是標記為TomLoxC的罕見基因形式，其DNA基因啟動子的版本大多不同，”該論文的共同作者James Giovannoni 在一份聲明中說道。“該基因通過催化許多脂質-揮發物的生物合成來影響水果的味道- 這些化合物容易消失。”

根據他們自己的測試，研究人員認為，這種與味道有關的基因僅存在於2%的人工栽培西紅柿中，但在超過90％的野生西紅柿中發現。

Giovannoni說道：“在西紅柿的早期栽培品種中，似乎存在強烈的選擇壓力，或者至少沒有選擇這種版本的TomLoxC。這種形式在現代西紅柿中流行的增加可能反映了育種者對改善味道的新興趣。”

研究人員表示，獲取有關如此多西紅柿品種基因組的詳細數據將有助於育種者栽培更美味的作物，這些作物仍保留基因，使其能夠遠距離運送到超市。