在東航MU5735飛行事故發生後的第27天，東方航空公司恢復了涉事機型波音737-800的商業運營，復飛首趟航班為MU5843，從昆明飛往成都，搭載了170名乘客，為滿員狀態。據極目新聞報導稱，經過這段時間全面系統檢查，東航也嚴格按照民航適航標準和規章要求，有計劃地逐步恢復運營該型號客機。

報導中提到，4月16日一早，該架飛機還做了昆明本場的適應性飛行。飛常準顯示，該飛機於16日執飛MU200次航班，9時58分起飛，11時06分落地，起落地點都是昆明長水國際機場。

在這之前，有消息人士表示，此前停飛波音737-800，是一種確保安全的應急措施。經過這段時間的全面系統檢查，該司也嚴格按照民航適航標準和規章要求，有計劃地逐步恢復運營該型號客機。

4月11日，民航局相關負責人接受新華社採訪時表示，東航失事客機事故目前還在調查中，還不能給事故原因和性質下結論。事故調查工作正在按照程序緊張進行，各方將盡全力盡快查明事故原因，依法依程序發布有關信息。