在墨西哥發現的SARS-CoV-2變種T478K已確認在北美蔓延
據外媒報導,博洛尼亞大學藥學系和生物技術系的一個研究小組分析了100多萬個SARS-CoV-2基因組序列。這一分析讓他們得到了一種新變種的發現,在過去的幾周里,它主要在墨西哥傳播,但現在在歐洲也有發現。
研究人員發表在《Journal of Medical Virology》上的論文提出了這個所謂的“墨西哥變種”,其學名為T478K。跟其他毒株一樣,該變種會導致刺突蛋白髮生突變,進而使新冠病毒能附著並穿透目標細胞。
“這種變異在北美尤其是墨西哥的人群中越來越流行。截止到目前,這種變體覆蓋了該地區超50%的現有病毒,”該研究的協調人、博洛尼亞大學藥學和生物技術系教授Federico Giorgi說道,“刺突蛋白的突變在結構上位於跟人類受體ACE2相互作用的區域。新冠病毒附著在這個受體上、感染細胞,從而更有效地傳播感染。”
研究人員從分析國際數據庫中發現的近120萬個SARS-CoV-2基因組序列樣本開始,這些樣本的時間一直持續到2021年4月27日。他們最終在11435份樣本中檢測到新的T478K變異。這是一個月前呈現相同變體的樣本數量的兩倍。這種自2021年初以來的增長給研究人員敲響了警鐘。
“墨西哥變體”平均分佈在男性和女性及不同年齡層。這種變異在墨西哥所有已測序新冠病毒中佔52.8%,而在美國僅在2.7%的已測序樣本中出現。就歐洲而言,“墨西哥變體”已經在德國、瑞典和瑞士微弱地傳播。在意大利,它幾乎不存在,只有4例上報病例。
這種變體的突變位於刺突蛋白的一個區域,該區域負責跟人類受體ACE2相互作用:這是允許新冠病毒訪問細胞的機制。在過去幾個月成為關注焦點的所有變異中,類似的突變是常見的。事實上,最近的新冠病毒變種因其高感染率而引人注目,這使得它們在世界許多地區都很普遍。
研究人員在silico模擬中測試了T478K刺突蛋白的作用,結果發現這種突變的蛋白質可以改變表面靜電電荷。因此,它不僅可以改變跟ACE2人類蛋白的相互作用,還可以改變跟免疫系統抗體的相互作用從而阻礙藥物的療效。
“多虧了國際數據庫中的大量數據,我們可以通過監測新冠病毒變體在不同地理區域的傳播幾乎實時地控制局勢,”Giorgi總結道,“在接下來的幾個月裡繼續努力對於採取迅速有效的措施至關重要。”