科學家利用海綿更容易地檢測水生環境的eDNA
最近有研究指出科學家可以通過檢測動物定期丟到水環境中的DNA來判斷水生環境中存在哪些生物。一項新的研究表明,由於天然DNA捕獲“能手”海綿,這種做法可能很快就會變得更容易。
目前,研究人員必須過濾大量的水,以便找到動物在蛻皮或排便時排出的稀釋的“環境DNA”(或eDNA)。根據英國索爾福德大學海洋生態學家Stefano Mariani的說法,這種做法涉及多項工作,而且結果可能會受到過濾設備中存在的異地DNA污染的影響。此外,儲存的水樣中的DNA可能會在處理這些樣品之前降解。
考慮到這一點,他反而關注已經在海洋和淡水環境中生長的海綿。據報導,這些生物每天可過濾多達10000升的水,並在其組織中捕獲eDNA。
當Mariani和他的團隊分析了在南極和地中海聚集的海綿樣本時,他們發現了31個分類群的DNA 。這些物種主要是魚類,儘管來自南極洲的一個海綿樣本含有威德爾海豹和帽帶企鵝的DNA – 然而這主要是因為該樣本聚集在企鵝繁殖地附近。
此外,為了避免來自宿主材料的干擾,科學家利用DNA引物(一種短核酸序列)擴增脊椎動物的DNA,但對海綿本身的DNA沒有影響。
“海綿是理想的採樣單位,因為你可以在任何地方和每個水生棲息地找到它們,”Mariani說道。“此外,它們不是非常有選擇性的過濾器,它們不會逃跑,它們不會受到採樣的傷害- 你可以抓住一塊,它們將能很好地再生。”
遺憾的是,海綿樣品的採集並不總是實用的,例如當它們位於深水中時。為此,研究人員正在研究從其他水過濾生物中收集eDNA,如水母或鮭魚。
關於該研究的論文最近發表在《Current Biology》期刊上。