利用CRISPR技術破解古老謎題- DNA複製的最後一塊拼圖
佛羅里達州立大學的一個研究小組解開了一個古老的謎題——細胞的關鍵過程到底是如何進行監控的,這對於未來遺傳學研究意義重大。這一研究成果公佈在12月27日Cell雜誌上,由分子生物學David Herbert帶領他的博士生Jiao Sima完成。
對於細胞來說,DNA等遺傳物質定期進行複制,是所有生物體必不可少的過程,這決定了包括從頭髮顏色,到生物體對疾病的反應等。DNA複製是在20世紀50年代後期發現的,之後雖然全球各地的研究人員都試圖了解這一過程是如何被調節的,但依然有許多未解之謎。
“這真是一個謎,”Gilbert說,“複製似乎對我們試圖干擾它所進行的各種嘗試都能避開。雖然現在我們已經詳細描述了DNA複製過程,發現了它在不同細胞類型中的變化,以及在疾病中被破壞的情況。但直到現在,我們還找不到最後一塊拼讀——控制元件。”
在這項最新研究中,Sima在DNA分子上嘗試檢測了近一百個基因突變,希望能更好地解釋複製過程的工作原理。但令人沮喪的是,效果不佳。
之後,他們用盡可能高的3D分辨率的方法分析了DNA的單個片段,發現DNA分子上的三個序列經常相互接觸。為此研究人員利用先進的基因編輯技術CRISPR同時刪去了這三個區域。
結果證明,這三個元件是DNA複製的關鍵。
“刪除這些元件會令片段複製時間從最開始變成了最後,”Gilberts說,“這具有決定性意義。”
除了對複制時間的影響之外,刪除這三種元件也會導致DNA分子的3D結構發生顯著變化。
“我們首次在基因組中精確定位了調控染色質結構和復制時間的特定DNA序列,”Sima說,“這些結果指向一種可能的模型,即DNA如何在細胞內折疊,以及這些折疊模式如何影響遺傳物質的功能。”
這一發現更好地理解DNA複製是如何被調節的,開闢了遺傳學研究的新途徑。
“如果你在不同的地方和時間複製,你可能會組裝出一個完全不同的結構,”Gilberts說,“細胞在不同的時間可以使用不同的東西,當複制的東西改變時,遺傳信息的包裝也會發生變化。”